Fluorescensbaserad metod för kvantifiering av RNA-omsättning

Viktiga resultat som projektet gav

Trots att det övergripande målet att förbättra den metaboliska RNA-inmärkningen med hjälp av nya fluorescerande nukleotid-prodrugs inte kan anses uppfyllt har vi under projektets gång gjort avsevärda lärdomar gällande syntesvägen mot den fluorescenta nukleosiden 2CNqA. På detta sätt har Lanterna förbättrat en för företaget kritiskt laborativ process, vilket kommer bidra till att diversifiera vår produktkatalog.

Långsiktiga effekter som förväntas

Som resultat av projektet har en mer robust syntesväg mot 2CNqA-nukleosid tagits fram. Förutom att utgöra startpunkt för vidare arbete med prodrug-syntes kommer detta avsevärt förbättra våra möjligheter att syntetisera trifosfatvarianter av 2CNqA, vilken kan användas för mRNA-syntes, för att utveckla vår metaboliska inmärkning, samt för andra projekt med fluorescenta ATP-analoger. I ett vidare perspektiv hoppas vi med dessa verktyg kunna stödja utvecklingen av framtidens RNA-terapier.

Upplägg och genomförande

Viktiga landvinningar som stärker Lanternas synteskapabiliteter har gjorts i projektet, men som alltid när arbete ska utföras som är beroende av syntes av nya molekyler på vilka senare projektdelar beror, tillkommer en risk för förseningar. Vi identifierade denna risk från början men underskattade arbetet med att etablera syntesarbetet i ett nytt laboratorium. En lösning som diskuteras är att utföra tidiga delar av syntesarbetet med hjälp av externa resurser för att kunna fokusera på prodrug-kemin och utvärdering av målmolekylerna snabbare.