Etablera ett överförbart prokaryotiskt prime-editing-verktyg för sök-och-ersätt-genmodifiering

Syfte och mål

Projektet syftar till att utveckla ett proof-of-concept prime-redigeringsverktyg för att möjliggöra snabb och effektiv sök-och-ersätt-genteknik i industriella prokaryoter. I synnerhet avser projektet att utforska verktygets överförbarhet med målet att designa ett universellt bakterieverktyg med begränsad artsspecifik optimering, vilket därmed förenklar implementeringen av verktyget i olika laboratoriemiljöer.

Förväntade effekter och resultat

Projektet syftar till att demonstrera en proof-of-concept-tillämpning av en prime-redigeringsteknik i de utvalda bakteriearterna och därmed utöka deras verktygslåda för genredigering. Arbetet kommer att utvärdera redigeringens effektivitet och begränsningar, vilket möjliggör vidare optimering av verktyget och påskyndar stammenteknik i framtida projekt. Dessutom kommer projektet att bedöma möjligheten att utveckla ett överförbart verktyg kompatibelt med flera arter, vilket effektiviserar arbetsflödena för genmodifiering i olika laboratorier.

Planerat upplägg och genomförande

Det initiala verktyget kommer att utformas med kompatibla genetiska komponenter för alla tre valda arter för att förbättra överförbarheten. Verktygets användbarhet kommer sedan att undersökas samtidigt i de tre bakteriearterna med en fluorescensbaserad screeningsmetod för att bedöma redigeringseffektiviteten.